Fatture per ordini web

Ciao.
La mia procedura normale per clienti privati è la seguente:
Scarico l'ordine da web --> trasformo in ordine cliente --> converto in DDT
Apro la "vendita di cassa" e da li, tramite il tasto "altro Doc" collego il DDT attraverso la voce " collega alla cassa un doc. esistente" . A questo punto mi trovo il ddt e lo scontrino. La merce è pronta per partire. Questa procedura mi sembra abbastanza lineare.

Il problema è quando devo emettere una fattura, cioè se si registra un'azienda . Se emetto una fattura a posteriori i prodotti vengono scaricati dal magazzino due volte.
Quale la procedura che dovrei  seguire ?

Grazie.