Problema con procedura di esportazione

Buonasera,
abbiamo schedulata una procedura di esportazione con la quale facciamo un upload in ftp di un file csv. Alla fine della procedura appare il pop-up "upload completato" ma cosi facendo blocca la procedura di schedulazione automatica fino a che qualcuno non provvede manualmente a dare l'ok al pop-up.
Sarebbe possibile fare in modo che questa schermata si chiuda in automatico d in modo tale da non dover dare più l'ok manualmente?
Vi ringrazio anticipatamente